@호이샤일단 그래픽카드 소음 자체는 거의 팬소음의 경우가 많으니
http://www.palit.com/palit/thundermaster.php?lang=kr 해당 프로그램 이용해서 
팬속도를 수동으로 조절해보시면서 진동 및 소음 잡아보시길 바랍니다 ㅠㅠ..

아니면 그래픽카드 지지대 때문에 전체적으로 케이스에 진동이 옮겨져서 불편함을 겪고 있는게 아닌가도 싶습니다
직접 눈으로 보고 판단하면 좋겠지만 글로만은 한계가 있는지라 명확한 답을 못내어드려 죄송합니다

@호이샤직접 만져보면서 테스트 진행해보는게 가장 베스트지만 
현재 사진이랑 상황 설명만으로 판단해보자면,
배그 돌리면서 그래픽카드 로드율 올라가면서 그만큼 팬속도도 빨라져서
소음과 진동을 유발하는게 아닐까로밖에 생각이들지 않습니다.

우선은 제가 링크 걸어드린 썬더마스터로 여러가지 수동 설정 거쳐보시고,
그래픽카드 자체에 팬불량이나 문제가 아니라면, 해당 제품이 그정도의 소음이나 진동을 원래 발생하는게 아닐까 싶습니다.

@호이샤단순히 제 생각과 제 의견뿐이니, 다른분들의 의견 또한 들어보시고
여러가지 경우의수를 참고해보셔서 잘 해결되시길 바랍니다 ㅠㅠ